| 序号 | 年度 | 奖项 | 等级 | 名称 | 获奖者及排名 |
| 1 | 1984年 | 北京市科技进步奖 | 三等 | 小儿肺炎呼吸衰竭时的高乳酸盐血症和乳酸酸中毒 | 杨永弘、江载芳、顾岑、张淑华、胡宗英 |
| 2 | 1993年 | 卫生部科技进步 | 三等 | HIB在我国小儿严微生物免疫室重感染性疾病病原学中的地位的研究 | 杨永弘、江载芳、冷志勤、沈叙庄、张桂荣 |
| 3 | 1994年 | 安徽省科技进步 | 三等 | HIB在我国小儿严重感染性疾病病原学中的地位的研究 | 冷志勤、杨永弘、陆达林 |
| 4 | 1994年 | 北京市科技进步奖 | 三等 | B族链球菌在围产期感染诊断及抗血清COA试剂盒制备研究 | 杨永弘、申阿东、张景华、张淼 |
| 5 | 1995年 | 北京市科技进步 | 三等 | 我国小儿 A族链球菌感染性疾病及感染菌株学流行病学研究 | 沈叙庄、杨永弘、高薇、袁林 |
| 6 | 2000年 | 国际传染病学会（ISID） | 个人 | Carriage and antibiotic resistance of pneumococcus in Chinese children | 杨永弘 |
| 7 | 2002年 | 北京市科技进步 | 二等 | 制备粘膜免疫的 B族链球菌莢膜多糖结合物疫苗 | 沈叙庄、杨永弘、江载芳、李莉 |
| 8 | 2003年 | 北京市科技进步 | 三等 | B 族链球菌临床分离株表型和分子流行病学方法的研究 | 申阿东、杨永弘、黄醒华、张桂荣、胡翼云、王咏红 |
| 9 | 2004年 | 中华医学奖 | 二等 | B族链球菌感染分子流行病学及莢膜多糖结合蛋白疫苗制备研究 | 杨永弘、申阿东、沈叙庄、叶鸿瑁、黄醒华、胡翼云、江载芳、马延敏、张桂荣、王咏红 |
| 10 | 2006年 | 北京市科技进步奖 | 三等 | 我国儿科流感嗜血杆菌性疾病及分离株耐药分子流行病学研究 | 杨永弘、沈叙庄、江载芳、俞桑洁、王亚娟、姜敏、胡惠丽、胡翼云、刘钢、刘秀云 |
| 11 | 2006年 | 中华医学奖 | 二等 | 我国儿科流感嗜血杆菌性疾病及分离株耐药分子流行病学研究 | 杨永弘、沈叙庄、俞桑洁、江载芳、姚开虎、王亚娟、胡惠丽、姜敏、刘秀云、胡翼云 |
| 12 | 2008年 | 北京市科技进步奖 | 三等 | 儿科抗生素使用与常见细菌耐药监测及耐药机制研究 | 杨永弘、沈叙庄、俞桑洁、姚开虎、江载芳、姜敏、魏京海、董芳、马琳、王艳、吕萍、樊剑锋、张文双、丁辉、王爱华 |
| 13 | 2009年 | 中华医学奖 | 三等 | 儿科抗生素使用与常见细菌耐药监测及耐药机制研究 | 沈叙庄、杨永弘、俞桑洁、姚开虎、陆权、邓力、王艺、陈沅、王刚、王晓红、张泓、邓秋莲、张文双、王爱华、丁辉 |
| 14 | 2009年 | 高教部科研优秀成果奖 | 二等 | 儿科抗生素使用与常见细菌耐药监测及耐药机制研究 | 杨永弘、沈叙庄、俞桑洁、姚开虎、王艺、陆权、邓力、陈沅、张文双、王爱华、范茂槐 |
| 15 | 2011年 | 中华预防学奖 | 二等 | 肺炎链球菌与b型流感嗜血杆菌儿科疾病及相关研究 | 杨永弘、沈叙庄、姚开虎、王亚娟、俞桑洁、胡惠丽、刘小荣、高薇、袁林、李艳 |
| 16 | 2012年 | 呼吸医师奖 | 个人 | | 杨永弘 |
| 17 | 2015年 | 中华预防医学会科学技术奖 | 一等 | 重要和新发现呼吸道病毒的病原学研究及其应用 | 王健伟、许文波、申昆玲、毛乃颖、李太生、朱 贞、郭 丽、崔爱利、谢正德、张 燕、范洪伟、周红莉、肖 艳、于德山、余鹏博 |
| 18 | 2015年 | 教育部高等学校科学研究优秀成果奖（科学技术） | 二等 | 重要和新发现呼吸道及肠道病毒的病原学研究及其应用 | 王健伟、任丽丽、许文波、郭丽、毛乃颖、相子春、朱贞、肖艳、崔爱利、周红莉、张勇、杨帆、谢正德、李太生、董杰 |
| 19 | 2016年 | 北京市科技奖 | 三等 | 我国儿童肺炎链球菌疾病和分离菌株特性的研究 | 杨永弘、姚开虎、俞桑洁、王亚娟、郑跃杰、胡惠丽 |
| 20 | 2018年
| 北京市科技奖 | 三等 | 白化病的基因诊断及发病机制研究 | 李巍、魏爱华、郝振华、郝婵娟、马静、何新
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| 21 | 2019年 | 华夏医学科技奖 | 三等 | n-3多不饱和脂肪酸及其甘油三酯基础代谢与相关应用研究 | 齐可民，樊超男，朱海燕，田春雨，夏露露，刘新丽，申文雯，付慧聪，董华，王翠，郑东旖，江津，徐锋，卢燕飞 |
| 22 | 2019年 | 河北医学科技奖 | 一等 | BRAF和TERT基因突变与儿童分化型甲状腺癌恶性程度的研究 | 耿江桥、倪鑫、王生才、郭永丽、宋英鸾 |
| 23 | 2020年
| 北京市医学科技奖 | 一等 | 儿童头颈肿瘤综合诊疗体系建立 | 倪鑫、葛文彤、张杰、刘原虎、邰隽、马晓莉、郭永丽、刘海红、许志飞、王生才、鲁洁、赵靖、陈敏、唐力行、王桂香 |
| 24 | 2021年 | 北京市科学技术奖 | 二等 | 儿童重大恶性实体肿瘤综合诊疗体系建立 | 倪鑫、马晓莉、赵军阳、王焕民、郭永丽、曾骐、葛明、王生才、葛文彤、张杰 |
| 25 | 2021年
| 华夏医学科技奖 | 二等 | 儿童重大恶性实体肿瘤综合诊疗体系建立 | 倪鑫、马晓莉、赵军阳、王焕民、郭永丽、曾骐、葛明、王生才、葛文彤、张杰 |
| 26 | 2022年 | 北京医学科技奖 | 一等 | 儿童急性早幼粒细胞白血病减化疗、去化疗新策略的建立和推广应用 | 郑胡镛、王天有、蒋慧、胡绍燕、廖宁、沈笛颖、田新、邵静波、张瑞东、高超、王林娅、张元元、林巍、吴颖、于皎乐 |
| 27 | 2023年 | 北京市科学技术奖
| 二等 | 结核病关键诊断技术的创新性建立及应用 | 黄海荣、于霞、焦伟伟、申阿东、陈素婷、孙琳、綦辉、林艺志、姜广路、尤其敏
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| 28 | 2023年 | 中华医学科技奖 | 三等 | 结核病关键诊疗技术的建立及推广应用 | 黄海荣、申阿东、陈非、王桂荣、于霞、綦辉、孙琳、焦伟伟 |
| 29 | 2023年 | 华夏医学科技奖
| 三等 | 结核病创新诊疗技术的建立及推广应用 | 黄海荣、初乃惠、陈非、于霞、孙琳、陈素婷、申阿东、林艺志 |
| 30 | 2023年 | 中国出生缺陷干预救助基金会科学技术奖 | 个人 | 杰出贡献奖
| 李巍
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| 31 | 2023年 | 妇幼健康科学技术奖科技成果奖 | 三等
| 遗传性出生缺陷的病因学研究与综合防控实践 | 郝婵娟、李巍、倪鑫、钱素云、徐保平、胡旭昀、郭若兰、陈元颖
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| 2024年 | 山西省自然科学奖 | 二等 | 血浆外泌体PD-L1促进人恶性肿瘤免疫逃逸的分子机制及其临床应用价值
| 李高鹏、王国亮、刘挺、李峰、陶凯
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| 33 | 2024年 | 北京医学科技奖
| 二等 | 中国儿童革兰阳性球菌分子流行病学及耐药监测与精准治疗 | 钱素云、姚开虎、杨梅、樊超男、史伟、王青、王丽娟、刘颖超、徐艳、李科纯、高薇、方伯梁、刘刚、袁林、李峥 |
| 34 | 2024年 | 河南医学科技奖 | 三等
| 儿童肺炎支原体肺炎分子检测技术创新及临床应用
| 李利锋、申阿东、孙琳、孙慧清，郭鹏波、李明超、宋晓蕊 |
| 35 | 2024年 | 河南省教育厅科技成果奖 | 二等
| 儿童肺炎支原体肺炎流行特征及分子检测技术创新与应用 | 李利锋、申阿东、孙琳、张耀东、郭鹏波、马嘉悦、宋晓蕊、郑璇、王彦红 |
