北京儿童医院是一所综合性大型儿科医院，其门诊每年接待全国各地及本市各区县儿童患者100多万人次。出门诊专家150余名，包括知名专家40余名；各科各专业均有主治医师以上临床经验丰富的医生出诊。门诊设有内科、外科、中医科、耳鼻喉科、眼科、口腔科、小儿妇科、皮肤科、血液中心、神经康复中心、急救中心、哮喘中心、保健中心等10余个临床科室，设有呼吸、哮喘、结核、心内、消化、肾脏、神内、血液、内分泌、免疫、风湿病、肝脏、心理、营养、腹痛、遗尿、小儿妇科、新生儿内科、新生儿外科、肛肠、肿瘤、泌尿外科、骨科、神外、心外、胸科等专家专病门诊。 门诊尚有设备先进的功能检查科室，包括心脏彩超室、腹部B超室、CT室、数字照相室、胃电图室、纤维胃镜室、脑电图室、脑血流图室、呼吸功能室等，为方便病人，特别是外地病人，大部分检查均可当日进行，预约不超过3天。医院为满足各层次病人的需要，在新门诊楼六层设有特需门诊，提供便捷、高档的服务。
　　2003年6月1日新开诊的门诊大楼共有十二层，总面积36990m2。一至八层为各科门诊，一层大厅设有初检处、挂号处、咨询处、接待室和静脉取血室，地下一层为药房和收费处。每层的候诊区有儿童游乐区，为病儿和家长提供方便而舒适的就诊环境。北京儿童医院始终坚持“以病人为中心，病人至上”的服务宗旨，保证儿童的健康成长是我们的使命，为病人真诚的服务是我们的职责，病人的康复和满意是检验我们服务质量的标准。